Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkn3Q8K045 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms