Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms