Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgefQ8CHT1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms