Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hpf1Q8CFE2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hpf1Q8CFE2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hpf1Q8CFE2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hpf1Q8CFE2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hpf1Q8CFE2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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