Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms