Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8CDS7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms