Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms