Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Lrif1Q8CDD9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Lrif1Q8CDD9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Lrif1Q8CDD9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Lrif1Q8CDD9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Lrif1Q8CDD9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrif1Q8CDD9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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