Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Riox2Q8CD15 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Riox2Q8CD15 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms