Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slfn5Q8CBA2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms