Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms