Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa5Q8C7G5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa5Q8C7G5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms