Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stbd1Q8C7E7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms