Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms