Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ubqln3Q8C5U9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ubqln3Q8C5U9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ubqln3Q8C5U9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubqln3Q8C5U9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubqln3Q8C5U9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubqln3Q8C5U9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln3Q8C5U9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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