Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cwc22Q8C5N3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc22Q8C5N3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms