Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms