Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssuh2Q8C3L1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms