Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0V9

Frmd6, FERM domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd6Q8C0V9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd6Q8C0V9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms