Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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