Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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