Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms