Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy1Q8BIJ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms