Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms