Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms