Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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