Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.5Q85ZW7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms