Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atg4cQ811C2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4cQ811C2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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