Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms