Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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ChfrQ810L3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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ChfrQ810L3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms