Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cldn34b3Q80ZS5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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