Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cracr2bQ80ZJ8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms