Protein–RNA interactions for Protein: Q80XI4

Pip4k2b, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2bQ80XI4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pip4k2bQ80XI4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4k2bQ80XI4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms