Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pnma8aQ80VM8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms