Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc155Q80VJ8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc155Q80VJ8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms