Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms