Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims3Q80U57 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms