Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Avl9Q80U56 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms