Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Clec18aQ7TSQ1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Clec18aQ7TSQ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Clec18aQ7TSQ1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Clec18aQ7TSQ1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Clec18aQ7TSQ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Clec18aQ7TSQ1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clec18aQ7TSQ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Clec18aQ7TSQ1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Clec18aQ7TSQ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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