Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf516Q7TSH3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms