Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms