Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Raver2Q7TPD6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms