Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TwistnbQ78WZ7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms