Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed3Q78IS1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms