Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mindy1Q76LS9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms