Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssh1Q76I79 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms