Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rph3alQ768S4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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