Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27lQ6ZWY3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms