Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms