Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nemp1Q6ZQE4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms